عزل وتشخيص بعض الأحياء المجهرية المرضية بين المرضى المصابين بعدوى المسالك البولية ودراسة الجينات المسؤولة عن مقاومة المضادات الحيوية

Isolation and Identification of some Pathogenic Microbes among Patients with Urinary Tract Infection and Study of Antibiotics Resistant Genes
البحث في الرسائل
الباحث
كرار كاظم شبلاوي الجاسمي
المشرف
أ.د. فاطمة عبد الحسين مجبل
الجامعة
جامعة الكوفة
الكلية / القسم
العلوم / علوم الحياة / الأحياء المجهرية
الشهادة
ماجستير
السنة
2022
لغة الرسالة
انكليزي
الكلمات المفتاحية
Urinary Tract Infection;Pathogenic Microbes;Antibiotic Resistance Genes;Molecular Identification

الملخص

تهدف هذه الدراسة الى عزل وتشخيص بعض أنواع البكتريا والخمائر التي تسبب التهاب المجاري البولية في كلا الجنسين و دراسة تأثير بعض عوامل المشجعة التي تؤدي الى تطور التهاب المجاري البولية وايضا التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن مقاومة المضادات الحياتية. تم جمع 278 عينة أدرار من منتصف جريان الادرار من مرضى في مختلف الاعمار وتتراوح من (80_11) سنة ومن كل الجنسين والذين يعانون من التهاب المجاري البولية والذين راجعو مستشفى الزهراء في محافظة النجف الأشرف والمختبرات الطبية الخاصة في المحافظة خلال الفترة من تشرين الثاني 2021 الى آذار (2022) تم تصنيف العينات حسب الجنس الى ذكور (81_ %29,2( و SUI (197 عينة _ %70,8( وعينات الإناث أيضا تم تفسيمها حسب فترة الطمث الى مرحلة ما قبل انقطاع الطمث )123 عينة %44,2( ومرحلة بعد انقطاع الطمث )74 عينة_ %26,6( وكانت عدد العينات الفعلية 236 عزلة بكتيرية وخميرة (198 عزلة بكتيرية و38 خميرة)اما العينات السالبة التي لم يظهر فيها نمو كانت 42 عينة .و تظهر النتائج ان السبب الاكثر شيوعا لالتهاب المجاري البولية هو الاشيريشيا القولونية )%41,9( وتليها الكلبسيلا الرئوية )%11,9( والمنقلبة الرائعة (01,7/) والمكورات المعوية البرازية )%2,1( المكورات العنقودية الرخامية )%3,8( والمكورات العنقودية الذهبية )%6,8( والمكورات العنقودية )%3( والبكتيريا العقدية )1 ,%2( وبكتريا المعوية )%3,8( والزائفة الزنجارية )%2,1( والسالمونيلا )1 ,%2( والستروبكتريا (01,3/) وبكتريا السيرشيا )%1,3( وخميرة المبيضات البيض )%2,1( وخميرة المبيضات كروسي )%14( تظهر النتائج ايضا ان الممرضات التي تسبب التهاب المجاري البولية تكون في الغالب معزولة من الاناث (9070,8) مع الفئات العمرية في وقت مبكر قبل انقطاع الطمث وبعد انقطاع الطمث العزل والتشخيص وفحص الحساسية الدوائية للمضادات الحياتية تمت بطريقتين وهما الطريقة التقليدية اليدوية والطريقة الذاتية باستخدام جهاز ALL وأظهرت نتائج اختبار الحساسية الدوائية على العزلات البكتريية .أن العديد من البكتريا كانت مقاومة لمعظم المضادات الحياتية باستخدام أكثر المجموعات المضادات الحياتية شيوعا بما في ذلك سيفالوسبورين والبنسلين والامينوغليكوزيدات والتتراسايكلين والماكرولايدات والسلفوناميدات وترايمييثوبريم سلفوناميدات وتضمنت هذه الدراسة ايضا دراسة جزيئية للجينين (677/, (oxa والمسؤولين عن مقاومة المضادات الحياتية المعزولة من الاشيريشيا القولونية والكلبسيلا الرئوية باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل.

Abstract

This study aimed to isolate and identify the some types of bacterial and yeast cause's urinary tract infection in male and female , Studying the effect of some risk factors that develop UTIs ,and Diagnosing some genes responsible for antibiotic resistance. A total of 278 mid-stream urine specimens have been collected from patients with different age group(11-80 years) and both sexes suffering from urinary tract infections whom attended to the hospitals in Al Najaf Al Ashraf province and private medical laboratories in AL Najaf for consultancy during the period from November 2021 to March 2022 .The samples classified according to gender into males(81samples-29.2%) and females(197 samples- 70.8%)which can be subdivided into pre-menopause( 123 samples -44.2%) and post-menopause(74 samples-26.6%). Out of 236 bacterial and fungal isolates (198 bacterial isolates and 38 yeast isolates) . The results show that UTI most commonly caused by Escherichia coli (41.9% ), Klebsiella pneumoniae (11.9%), Proteus mirabilis( 1.7%), Enterococcus faecalis(2.1%), Staphylococcus saprophyticus(3.8%),Staphylococcus aureus(6.8%),Staphylococcus spp. (3%),Streptococcus spp(2.1%),Enterobacter(3.8%),Pseudomonas auroginosa(2.1%) ,Salmonilla(2.1%), Citrobacter(1.3%), Serratia(1.3%),Candida albicans(2.1%) and Candida krusi(14%). The results also show that uropathogens that cause UTIs are most commonly isolated from females(71.2%) with age groups early premenopausal and postmenopausal . Confirm the initial isolation and identification and antibiotic susceptibility by using conventional method and VITEK 2. Results of susceptibility test on isolates showed many of bacteria were resistant for most antibiotic ,by using the most common antibiotic groups including cephalosporin, penicillin ,aminoglycosides ,tetracyclines ,chloramphenicol, macrolides Sulfonamides and trimethoprim sulfonamides. This study involved molecular study of some genes(oxa gene and tem gene ) that responsible for antibiotic resistance isolated from E. coli and Klebsiella pneumoniae from urine samples by using PCR technique. By boiling method, isolate DNA for 18 samples(10 from E. coli and 8 K. pneumonia). The results show that all samples of both Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae does not possess oxa gene(with molecular weight 928 bp). While that of the tem gene (with molecular weight 766 bp) was present in all of the bacterial isolates of both Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae except one sample(K .pneumonia ) which did not possess tem gene ,that means all bacterial isolates of E. coli possess tem gene while some isolates of K .pneumonia does not carry this gene.

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.