التنميط الجيني وتوصيف بكتريا السالمونيلا المعزولة من الإبل في محافظة النجف الأشرف، العراق

الباحث

محمد نجاح عباس

المشرف

علي هادي عباس

الجامعة

جامعة الكوفة

الكلية / القسم

الطب البيطري / الأحياء المجهرية

الشهادة

ماجستير

السنة

2022

لغة الرسالة

E

الكلمات المفتاحية

السالمونيلا;الإبل;التنميط الجيني;النجف الأشرف

تم التعرف على السالمونيلا المعوية باعتبارها أحد مسببات الأمراض المنقولة عن طريق الأغذية الرئيسية والمهمة للإنسان والحيوان لأكثر من قرن. معظم الأنماط المصلية هي غير محددة المضايف وتسبب تسبب ela السلمونيلات غير التيفودي (NTS) التهاب المعدة والأمعاء لدى البشر والعلامات السريرية في المضيفات الحيوانية ، ويمكن للإنسان أن يصاب بالعدوى من اللحوم الملوثة. تعتبر لحوم الإبل في العراق خاصة في محافظة النجف من مصاددر اللحوم ، لكن NTS لم تتم دراستها بدقة. في هذه الدراسة ، قمنا بالتحقيق في التنوع السكاني ل Salmonella spp في الإبل وما هي أكثر أنواع NTS التي تعيش في هذا الحيوان المضيف ، باستخدام طريقة جزيئية تستهدف منطقة وراثية موحدة تعطي نمطأً مصلياً سريعاً مقارنة بالطرق الأخرى. بالإضافة إلى. معرفة مدى انتشار مقاومة المضادات الحيوية في السالمونيلا المعزولة خلال فترة الدراسة وتحديد أي من المضادات الحيوية أكثر مقاومة ، مما قد يشير إلى قلق الصحة العامة بشأن توزيع سمة مقاومة المضادات الحيوية. أجريت دراسة مقطعية لجمع 400 عينة براز من الإبل من مناطق بدو النجف ومسلخ المدينة وعزلت السالمونيلا المعوية من الإبل من مختلف الأعمار. تم جمع جميع العينات من مسحات برازية من الابل خلال الفترة من أغسطس إلى نوفمبر 2020 ، وتم إخضاع العينات التي تم جمعها لاختبارات كيميائية حيوية معينة للتعرف على السالمونيلا ، ثم تم التعرف عليها من خلال تفاعل البلمرة المتسلسل التقليدي باستخدام مواد أولية محددة تستهدف عامل FRNA تم إرسال منتجات PCR للتسلسل. أظهرت النتائج أن 32 )87( من العزلات تم تحديدها على أنها Salmonella spp وفي الوقت نفسه ، أظهر تحليل التسلسل أنه تم اكتشاف خمسة أنماط مصلية بين أعمار الإبل المختلفة. .؟, Enteritidis ،S. Kentucky S. Milwaukee ،Infantis .5 و Indiana § بمعدلات انتشار 1 )73.1( ، 7 )422( ، 1 )43.1( © 4 )412.5( و 19 )59.3%( ، على التوالى. كان معدل عزل S. Cle Indaina من الأنماط المصلية الأخرى في جميع الأعمار وفي عينات من البدو والعينات المعزولة من المسلخ. أظهر اختبار الحساسية للمضادات الحيوية أن نسبة المقاومة ضد المضادات الحيوية المختبرة كانت على النحو التالي: أمبيسلين 32 )1007( ، أموكسيسيلين 23 )727( ، سيفترياكسون 0 )07( ، سيفاليكسين 4 )775( ، جنتامايسين 20 )62.57( ، أميكاسين 3 (/9.5) ، تريميثوبريم 4 (/12.5) ¢ سلفاميثوكسازول 7 )753( ، التتراسيكلين 30 )947( ، الإريثروميسين 32 (1007) ، حمض الناليديكسيك 14 )447( © سيبروفلوكساسين 17 (537) ، الكلورامفينيكول 18 (/65). في الدراسة الحالية ، مقاومة الأدوية المتعددة أظهرت النتائج أن 18 (/56) من العزلات اعتبرت سلالات MDR ، بينما 14 )447( منها تم اعتبارها من سلالات XDR بشكل ،da yale أظهر الاختبار الجزيئي أن المعدل العالي غير العادي لعزلات السالمونيلا المعوية 32 )87( يحتوي على المنطقة الجينومية rn ated في الختام ، فإن المنطقة الجينومية المستهدفة من السالمونيلا ذات كفاءة عالية في تشخيص السالمونيلا إلى مستوى النمط المصلي 6 كما أنها dade لسير العمل لدراسة تجمعات السالمونيلا في العوائل. تمكنا في هذه الدراسة من اكتشاف الأنماط المصلية Indiana .5 و Kentucky .5 و S. Milwaukee 5S. Infantis و Enteritidis .5 لأول مرة في الإبل. فضلا عن الكشف عن Indiana .5 و S. Milwaukee لأول مرة في العراق. 5. إنديانا هي السلالة الأكثر انتشارًا في الإبل مع ميل كبير إلى أن تأويها الحيوانات صغيرة السن أقل من 3 أشهر.أظهرت النتائج ان انتشار مقاومة المضادات الحيوية لعزلات السالمونيلا لمختلف المضادات الحيوية كان مرتفعا.

Salmonella enterica has been recognized as a major and important foodborne pathogen for humans and animals for more than a century. Most of serotypes are host non- specific and causing Non- Typhoidal Salmonellosis (NTS) characterized by gastroenteritis in humans and clinical signs in animal hosts, and human can get infection from contaminated meat. In Iraq especially in Al- Najaf province, the meat of camel considered as source for human conception, yet NTS has not been studied vigorously. In this study, we have investigated the population diversity of Salmonella spp. in camels, by using a molecular method targeting a unified genetic region that gives a rapid serotyping compared to other methods (VITICK, serology and etc.) furthermore, know the extent of the spread of antibiotic resistance in isolated Salmonella during the study period and determine which of the antibiotics are more resistant, which could indicate a public health concern about distributing antibiotic resistance trait. A cross-sectional study was performed to collect a total of 400 rectal swabs from camel (6month- 4years male and female) from Al -Najaf nomadic regions and the city abattoir, Salmonella enterica was isolated from camels of different ages. All samples were fecal swabs collected during the period from August to November 2020, the collected samples were subjected to certain biochemical tests for the identification of Salmonella, and then identified using conventional polymerase chain reaction by applying specific primers targeting an rRNA operon rrnH. PCR products were sent to be sequenced. The results revealed that 32 out of 400 isolates (8%) identified as Salmonella spp. Meanwhile, sequence analysis showed that about five serotypes of Salmonella were detected among different camel ages. These serotypes were S. Infantis, S. Kentucky S. Milwaukee, S. Enteritidis and S. Indiana with prevalence rates of 1(3.1%), 7(22%), 1(3.1%), 4(12.5%) and 19(59.3%), respectively. the isolation rate of S. Indaina was higher than other serotypes in all ages and in samples from nomadic and from the abattoir The antibiotic susceptibility test, revealed that the resistance percentage against the tested antibiotics was as follow: Ampicillin 32(100%), amoxicillin 23(72%), ceftriaxone 0 (0%), cephalexin 24(75%), gentamycin 20(62.5%), amikacin 3(9.5%), trimethoprim 4(12.5%), sulfamethoxazole 17(53%), tetracycline 30(94%), erythromycin 32(100%), Nalidixic acid 14(44%), ciprofloxacin 17(53%), chloramphenicol 18(65%).In the current study, the multidrug resistance profile revealed that 18 (56%) of the isolates were considered as MDR strains, while 14(44%) of them were count as XDR. Significantly, the molecular test showed that extraordinary high rate of Salmonella enterica isolates 32(8%) was containing the genomic region of rrnH operon. In conclusion, the rrnH region of Salmonella is highly efficient in diagnosis of Salmonella to the serotype level and it is useful workflow to study Salmonella population in the hosts. In this study we were able to detect S. Indiana, S. Kentucky, S. Infantis, S. Milwaukee and S. Enteritidis serotypes for the first time in camel. As well as detection the S. Indiana and S. Milwaukee for the first time in Iraq. S. Indiana is the most predominant strain in camels with high tendency to be harbored by young aged animals < 3 months.

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.

الاسم

رقم الهاتف

البريد الإلكتروني

الغرض من الطلب (اختياري)

إرسال الطلب