التوصيف الجزيئي للشيكلا سوني Shigella sonnei المعزولة من إسهال الأطفال دون الخامسة من العمر والتنميط بالعاثي في الموصل / العراق

الباحث

عباس هاشم محسن مرعي

المشرف

أنمار أحمد داؤد الطائي

الجامعة

جامعة الموصل

الكلية / القسم

كلية العلوم / قسم علوم الحياة

الشهادة

ماجستير

السنة

2022

لغة الرسالة

انكليزي

الكلمات المفتاحية

Shigella sonnei ; Childhood Diarrhoea ; Molecular Characterization ; Phage Typing

عزلت بكتريا ال Shigella spp. من )150( عينة براز لأطفال يعانون من الإسهال ومن كلا الجنسين تتراوح أعمارهم بين )60-1( ed خلال الفترة من تشرين الأول 2021 إلى آذار 2022 في مدينة الموصل / العراق. شخصت العزلات بناءً على الخصائص الشكلية ، الكيموحيوية والايضية،؛ تم ast التشخيص باستخدام عدة ،eel نظام 2015 API و نظام VITEK2 ، وتم إختبار حساسيتها ل (14) نوعًا من المضادات الحيوية التي يشيع استخدامها في علاج الإسهال عند الأطفال. أظهرت نتائج عينات الزرع أن )135( due براز أعطت نموا إيجابيًا للبكتريا وبنسبة (90/) من العدد الإجمالي للعينات ، بينما لم تظهر العينات الأخرى البالغة (15) أي نمو وبنسبة )710( على اوساط العزل. أظهرت النتائج أن )17( عزلة تنتمي ل Shigella sonnei بنسبة (12.59/) من العدد الكلي للعزلات ، وضمن الفئة العمرية (60-49) شهراً . سلالات ال Shigella sonnei لديها القدرة على تكوين الأغشية الحيوية . لا تنتج جميع سلالات إنزيم الجيلاتينيز ، الحمض النوويء اليوريزء لم تكن محللة للدم على وسط أكار الدم. أظهر اختبار الحساسية للمضادات الحيوية أن جميع السلالات كانت مقاومة للمضاد الحيوي Z 100 (NA 30mg) Nalidixic acid ، كما أن )782.35( من السلالات كانت مقاومة للمضاد الحيوي Leis ، (Ampicillin (AMP 25mg) )788.23( من السلالات كانت حساسة لكل من Azithromycin (AZM15mg) و Chloramphenicol (C 10mg) ، كان المضاد الحيوي Ciprofloxacin (CIP 10mg) له 586 مثبطًا وأظهرت النتائج أن )7100( من السلالات كانت حساسة لها ¢ اماالجيل الثالث من المضادات الحيوية من السيفالوسبورين مثل CTX ( 8 رو Ceftriaxone(CRO 10mg) لها القدرة على Lid سلالات Shigella sonnei بنسبة )770.58( و )770.58( على التوالي،بينما كانت السلالات حساسة ل Cefixime (CFM5mg) بمعدل )241.17( . وبنسبة (100/) كانت حساسة للمضاد الحيوي (IPM10mg) 23 بببينما كانت السلالات حساسة لكل من المضاد الحيوي(412101508) Amikacin و Tetracycline(TE10mg) على التوالي (64.70/) و ( 758.8( . اما بالنسبة للمضاد الحيوي Nitrofurantion F 100mg) كانت السلالات حساسة بنسبة(6658.82)، بينما كانت السلالات مقاومة للمضاد الحيوي Gentamicin )01110 mg) بنسبة(9647.05): واظهرت جميع السلالات مقاومتها للمضاد الحيوي Ceftazidime (CAZ 10mg) بنسبة )%100(- عزلت الملتقم البكتيري الخاص لبكتريا Shigella sonnei من مياه الصرف الصحي وتم تحديدعياريته لاستخدامها في تنميط العاثي. أجري تحليل تسلسل الحمض النووي ، وخاصة بالنسبة للجين الريبوزومي rRNA 165 ، والذي تم الاعتماد عليه لأنه تسلسل ثابت لا يتغير على مر السنين للأنواع والأجناس البكتيرية. تم إرسال الحمض النووي المستخلص بعد إضافة جينات التمهيد الأمامي والعكسي الخاصة والتضخيم ومضاعفة تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) إلى شركة Microgene لاستهداف الجين التشخيصي rRNA 165 ، وتم العثور على تسلسل الجين لجميع العينات (17). عند مقارنة النطاقات المكررة ، وجد أنها تتكون من )1460( زوجًا أساسيًا في الحجم وعلى نفس المستوى لجميع أنواع السلالات. تمت مقارنة نتائج هذه السلالات للتسلسل الجيني مع التسلسل الجيني للسلالات المعيارية المثبتة في قاعدة بيانات أداة المحاذاة العالمية الأساسية (BLAST) داخل NCBI تم تأكيد التشخيص مع نسب تشابه يتراوح بين (98- 7100/). وجد أن حجم القواعد النيتروجينية يصل إلى )1460( زوجًا قاعديًا عند الترحيل الكهربائي على هلام الاجاروز. 111011010101111 Lid” pals GAM aah © Ke Ech إنا فحنا “Af 204 Pa - - a ومَا تآخر ويم نعمنه Chingy CHE صراطا gee © ويِنْصرَك الله ماعرية 4 صَمَقَ الله التظليم سورة الفتح، الآية (3-1) 777077777777779 و03 8

This study was conducted to isolate Shigella spp. from (150) stool samples of children with both sex suffering from diarrhoea whose ages ranged from (1- 60) months during the period from October 2021 to March 2022 in Mosul / Iraq. The isolates were diagnosed based on morphological, biochemical and physiological characteristics, and the diagnosis was confirmed by using Biochemicals test, API 20E and VITEK2 compact system.Their sensitivity to (14) types of antibiotics commonly used in the treatment of diarrhoea in children was carried out. The results of culture samples showed that (135) stool samples gave positive growth about (90%) of the total number of samples, while the other samples (15) samples did not show any growth (10%) on the isolated media. The results showed that (17) isolates belong to Shigella sonnei, representing (12.59%) of the total number of isolates, The age group (49-60) months was in isolating to Shigella sonnei mostly present in age group (41.8%). Strains of Shigella sonnei had the ability to form biofilms, All strains of Shigella sonnei did not produce the enzymes Gelatinase, DNase,, Urease,, and all strains were not hemolysis blood on blood agar medium. The antibiotic susceptibility test showed that all strains were resistant to the antibiotic Nalidixic acid(NA 30mg) 100%, and Ceftazidine 100%, Also, (82.35%) of the stains were resistant to the antibiotic Ampicillin(AMP 25mg) , While (88.23%) of the strains were sensitive to both Azithromycin (AZM15mg) and Chloramphenicol(C 10mg), Ciprofloxacin(CIP 10mg) showed an inhibitory effect,100% of the strains were sensitive to Imipenem and Amikacin. The third- generation of cephalosporin antibiotics such as Cefotaxime(CTX 5mg) and Ceftriaxone(CRO 10mg) had the ability to inhibit Shigella sonnei strains with the rate(70.58%) and (70.58%) respectively. The strains were sensitive to Cefixime(CFM 5mg) with a rate of (41.17%), and at (100%) to the antibiotic Imipenem and to Amikacin(AK 10mg) and Tetracycline(TE 10 mg),(64.70%) and (58.8%) , the antibiotic Nitrofurantion(F 100mg), while resistant to the antibiotic Gentamicin(GN10 mg) 47.05% and the strains are resistant to the antibiotecs Ceftazidime(CAZ 10mg) was (100%). The study also involved the isolation of specific bacteriophage for Shigella sonnei from sewage water and its titer was determined use for phage typing results. The sequence analysis of the DNA was carried out, especially for the ribosomal 16S rRNA gene, it was relied upon because it is a fixed sequence that does not change over the years for bacterial species and genera. The DNA extract was sent to the Microgene Company to target the diagnostic gene 16SrRNA by adding the special Forward and Reverse primer genes and amplification and doubling polymerase chain reaction (PCR), It was found the sequence of gene for all the (17) samples was present in all strains. When comparing the duplicated bands, it was found that the bands were (1460) base pairs in size and at the same level for all types of strains. The results of these strains were compared for the genetic sequence with the gene sequence of the standard strains installed in the database Basic global Alignment Search Tool (BLAST) within National Center for Biotechnology Information (NCBI). The diagnosis was confirmed with a cause similarity ranging from (98- 100%).Found that the size of the nitrogenous bases reaches (1460) base pairs electroporation after 16SrRNA gene amplification by polymerase chain reaction (PCR).

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.

الاسم

رقم الهاتف

البريد الإلكتروني

الغرض من الطلب (اختياري)

إرسال الطلب