الكشف مظهرياً وجزيئياً عن بعض مسببات الأخماج البكتيرية لمرضى داء الذئب الاحمراري الجهازي في مدينة الموصل
Morphological and Molecular Detection of Some Bacterial Infection in Systemic Lupus Erythematosus in Mosul City
- الباحث
- نادية خالد مصطفى حامد العبيدي
- المشرف
- سحر سالم بطرس داود
- الجامعة
- جامعة الموصل
- الكلية / القسم
- كلية العلوم / قسم علوم الحياة
- الشهادة
- ماجستير
- السنة
- 2023
- لغة الرسالة
- عربي
- الكلمات المفتاحية
- الذئب الاحمراري الجهازي ; الأخماج البكتيرية ; الكشف الجزيئي ; مدينة الموصل
الملخص
تضمنت الدراسة جمع 75 عينة سريرية من مرضى مشخصين بداء الذئب الأحمراري Systemic Lupus Erythematosus (SLE) سواء من المرضى الراقدين أم المراجعين لمستشفى ابن سينا التعليمي في مدينة الموصل لأغراض تلقي العلاج وللمُدّة من شهر تشرين الثاني 1 إلى شهر نيسان 2022. شملت العينات السريرية 60 عينة من الإدرار 58٠ مسحات من التقرحات الفموية، 5 lise القشع، ومسحة من القيح المأخوذ من جرح واذن. كما جمعت 10 عينات لغسول all من 10 من مرضى ال SLE في مُدَّةَ سكون المرضء، و 10 عينات لغسول فم لأشخاص اصحاء كعينة سيطرة (مقارنة). شخصت العزلات النامية على الأوساط الزرعية الانتخابية والغنية بالطرائق التقليدية وباستخدام أشرطة STAPH, API20E “821 وجهاز <Vitek-2 وتم تأكيد التشخيص بوساطة الطرائق الجزيئية المعتمدة على 16S rRNA ثم مقارنة التتابعات في المركز الوطني لمعلومات التقنيات الحياتية (National Center for Biotechnology Information(NCBI) وياستخدام برنامج -(BLAST) Basic Local Alignment Search Tool شخصت 70 عزلة بكتيرية من العينات السريرية، 22 )%31.4( منها موجبة لصبغة كرام، و 48 )%68.6( سالبة لصبغة كرام. توزعت العزلات الموجبة كما يأتي 14 عزلة من الإدرار، 3 من القشعء 5 من تقرحات الفمء Lal العزلات السالبة فكانت 41 عزلة من الإدرار، عزلتين من القشع، 3 عزلات من التقرحات الفموبة وعزلة واحدة لكل من قيح الجرح والأذن. كانت السيادة للبكتيريا الموجبة لصبغة كرام ل Staphylococcus aureus المعزولة بنسبة tal ،(% 14.3) البكتيريا السالبة لصبغة كرام فالسيادة د Pseudomonas aeruginosa التي عزلت بنسبة )24.3 %( شملت البكتريا الموجبة لصبغة كرام كل من: Staphylococcus aureus, Staph. haemolyticus, Staph. | Warneri, Staph. epidermidis, Kocuria kristinae, *Granulicatella elegans, *Pediococcus pentosaceus, Enterococcus faecalis and Streptococcus pneumoniae. ما البكتيريا السالبة لصبغة كرام فشملت كل من: Pseudomonas aeruginosa, *Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas luteola, *Pseudomonas_ oryzihabitans, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, *Cronobacter sakazakii, Klebsiella pneumoniae, *Serratia fonticola, Proteus mirabilis, *Proteus penneri, *Proteus vulgaris, *Providencia stuartii, Acinetobacter baumannii, *Ochrobactrum anthropi, Salmonella typhi and Aeromonas hydrophila. الحساسية تجاه العديد من المضادات الحيوية للعزلات البكتيرية وبحسب نوع GLAS! أجري Extensively (XDR)، Multidrug Resistant (MDR) العينة ونوع البكتيرياء ثم تم تحديد للعزلاتء إذ بلغت لبكتيريا 892 Drug Resistant (PDR); Drug Resistant 2/20 ،%50 E.coli على التوالي ولبكتيريا Staphylococcus aureus 20%,70%,10% . على التوالي %5.9 ،%5.9 6%88.2Pseudomonas aeruginosa وذ 0 كونها المعزولة Pseudomonas aeruginosa ايرتيكب لدراسة بعض من عوامل ضراوة بنسبة أعلى من العينات السريرية، تم الكشف مظهريا عن قابلية 10 عزلات منها (التي اظهرت أعلى بطريقة الزرع على وسط أكار Biofilm مقاومة للمضادات الحيوية) على تكوين الغشاء الحيوي أظهرت 4 عزلات منها نتيجة إيجابيّة. ثم تم التحري جزيئيًا ، Congo Red Agar ya) الكونغو وباستخدام البوادئ PCR بتفاعل 2114 , pslA عن تكوين الغشاء الحيوي بالكشف عن المورثين الخاصة بهماء إذ أظهرت النتائج امتلاك العزلات الأربعة على الموريث //ىم فيما امتلكت ثلاث منها المورثين Lady كما تم التحري جزيئيًا عن مورثات المقاومة لبعض المضادات الحيوبة PIA المورث 6و 7الأريعة، وأظهرت النتائج امتلاك 1/00110105 aeruginosa في عزلات mexA, 514 يدع 510 امتلكت عزلتين فقط المورث ررب Lad العزلات الأربعة للمورث 4د7:6، أظهرت نتائج زرع عينات غسول الفم سيادة أنواع من البكتريا الانتهازية السالبة لصبغة كرام إذ شخصت 18 عزلة مقارنة ب 4 عزلات من فم الأصحاء . وشخصت 12 عزلة SLE في فم مرضى مقارنة ب 6 عزلات من فم الأصحاء. Staphylococcus موجبة لصبغة كرام تابعة للجنس شملت البكتريا الموجبة لصبغة كرام كل من: Staphylococcus aureus, Staph. —haemolyticus, — Staph. warner, Staph. epidermidis and Staph. saprophyticus. اما البكتيريا السالبة لصبغة كرام شملت كل من: Pseudomonas aeruginosa, *Pseudomonas putida, Pseudomonas. stutzeri, Escherichia coli, *Enterobacter gergoviae, Klebsiella pneumoniae, * Acinetobacter baumannii, * Alcaligenes faecalis. أنواع البكتريا المؤشرة بالعلامة * عزلت محليا للمرة الاولى من مرضى Gi الجدير بالذكر -SLE
Abstract
A In the present study, (75) clinical specimens were collected from diagnosed Systemic Lupus Erythematous (SLE) patients (inpatients and outpatients) during the period from November/2021 - April /2022. Specimens consisted of (60) urine samples, (8) oral ulcers swabs, (5) sputum and one pus sample taken from each of wound and ear . In addition to (10) oral rinse samples from SLE patients at its latent period and (10) oral rinse samples from healthy people to be used as control. All bacterial isolates grown on selective and enriched media were identified using conventional methods, API E 20 , API@ STAPH , and Vitek- 2 and finally confirmed by using the more reliable 16S rRNA molecular identification methods. Gene sequencing was compared with National Center for Biotechnology Information (NCBI) by using Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) . The identification results of (70) bacterial isolates obtained from clinical samples were as follows; 22 (31.4%) were gram positive, 48 (68.6%) gram negative. Of the gram positive bacteria (14) were isolated from urine, (3) from sputum and (5) from oral ulcer. On the other hand, gram negative bacteria consisted of (41) urine isolate, (2) from sputum samples, (3) from oral ulcers, and (2) pus samples from wound and ear. The most prevalent gram positive bacteria were: Staphylococcus aureus, Staph. haemolyticus, Staph. Warneri, Staph. epidermidis, Kocuria kristinae, Granulicatella elegans, *Pediococcus pentosaceus, Enterococcus faecalis and Streptococcus pneumoniae. Furthermore, gram negative bacteria included: B Pseudomonas aeruginosa, *Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas luteola, *Pseudomonas oryzihabitans, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, *Cronobacter sakazakii, Klebsiella pneumoniae, *Serratia fonticola, Proteus mirabilis, *Proteus penneri, *Proteus vulgaris, *Providencia stuartii, Acinetobacter baumannii, *Ochrobactrum anthropi, Salmonella typhi and Aeromonas hydrophila. Antimicrobial sensitivity testing was carried out for all isolates according to the type of bacteria. Multidrug Resistance (MDR), Extensively Drug Resistance (XDR) and Pan Drug Resistance were also determined. Results for Staphylococcus aureus were 10%, 70%, and 20% respectively. In case of E. coli, results were 50%, 20%, 20%, and for Pseudomonas aeruginosa 88.2%, 5.9% and 5.9% respectively. Virulence factors for the most prevalent bacteria isolated, Pseudomonas aeruginosa were also studied. Detection of biofilm formation for 10 multiresistant Pseudomonas aeruginosa was detected by Congo red agar method. Positive results were observed by four (4) isolates. Additionally, molecular detection of two genes PilA and pslÁ was performed using PCR technique and their specific primers. All four isolates demonstrated the presence of pslÁ while only three carried the gene PilA. Similarily, the presence of antimicrobial resistance genes (mexA, blaCTX-M1) was carried out and it was found that all four isolates contained mexA gene while only two isolates contained the gene blaCTX-M1 . The current study also demonstrated the prevelance of many types of opportunistic gram negative bacteria present in oral rinse samples of SLE patients. This was manifested by isolation of 18 bacterial isolates as compared with (4) obtained from healthy people. 12 gram positive bacteria were diagnosed as Staphylococcus compared to (6) isolates from control . Gram positive bacteria included each of: Staphylococcus aureus , Staph. haemolyticus, Staph. warneri, Staph. epidermidis, Staph. Saprophyticus. While gram negative bacteria included: Pseudomonas aeruginosa, *Pseudomonas putida, Pseudomonas stutzeri, Escherichia coli, *Enterobacter gergoviae, Klebsiella pneumoniae, * Acinetobacter baumannii, * Alcaligenes faecalis. An interesting finding was that bacterial names assigned with (*) were isolated from local SLE patients for the first time as far as we know.
طلب نسخة من الملف
الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.