الكشف الجزيئي عن بعض عوامل ضراوة بكتريا Citrobacter spp. المعزولة من إصابات الحروق والجروح ومحاولة تثبيطها
Molecular Detection of Some Virulence Factors for Citrobacter spp. Isolated from Burn and Wounds Infection and Try Inhibition it
- الباحث
- علي صلاح محمود يونس الحسيني
- المشرف
- غادة عبد الرزاق محمد ابراهيم
- الجامعة
- جامعة الموصل
- الكلية / القسم
- كلية العلوم / قسم علوم الحياة
- الشهادة
- ماجستير
- السنة
- 2024
- لغة الرسالة
- عربي
- الكلمات المفتاحية
- بكتريا Citrobacter ; عوامل الضراوة ; الحروق والجروح ; الكشف الجزيئي
الملخص
شملت الدراسة جمع (112) عينة سريرية (من مسحات الجروح وحالات الحروق) من الراقدين في المركز التخصصي Gy pall والجروح التجميلية في مدينة الموصل للفترة من أيلول 2022 الى نهاية يناير 2023، للأعمار التي تراوحت من (2 الى 55) سنة لكلا الجنسين، ولغرض عزل أنواع بكتيريا Citrobacter spp منها. أشارت النتائج إلى عزل )5( سلالات بكتيرية ،Citrobacter spp ثلاث منها تنتمي إلى النوع C. freundii وعزلة واحدة لكل من C. werkmanii و farmeri. .00 . وقد شخّصت العزلات بأعتماد التشخيص الروتيني وتأكيده باستخدام جهاز ،Vitek-2 وتم تأكيد التشخيص باستخدام الطرائق الجزبئية بمقارنة تتابعات القواعد النتيروجينة باستخدام (yal) 1657/97/4 في المركز الوطني لمعلومات التقانات الحياتية NCBI باستخدام برنامج BLAST . تم اختبار حساسية انواع بكتريا Citrobacter تجاه )11( من المضادات الحيوية وأظهرت النتائج أن جميعها كانت مقاومة بنسبة 96100 لمضادات التتراسايكلينات Doxycycline , Tetracycline و Oxy tetracycline بينما كانت حساسة ل Trimethoprim , Amikacin , Norfloxacin , Levofloxacin , و Ciprofloxacin . تم الكشف عن وجود البلازميدات في أنواعها وأظهرت النتائج احتواء اربع عزلات من Citrobacter على البلازميدات ماعدا العزلة التابعة للنوع farmari .0) لم تحتوي على أي بلازميد. بعد ذلك تم chal تحييد هذه البلازميدات بالطريقة الفيزيائية (الحرارة العالية 45 م) و الطريقة الكيميائية (اليوريا بتراكيز100 ٠ 200 ٠ 400 مايكروغرام/سمة ). وأخيرا استعملت مواد طبيعية لأول مرة وهي كل من مستخلصات البصل والثوم بثلاثة تراكيز لكل منها cL) 65 10 %( لغرض اختبار قدرتها بوصفها عوامل محيدة للبلازميدات، أظهرت النتائج clas الطريقة الفيزبائية والكيميائية في التحييد, اما عند استعمال المحيدات الطبيعية لمستخلصي الثوم والبصل فقد أخفق البصل بكل التراكيز المستخدمة فيما نجح الثوم بالتحييد في التركيزين %1055 bt فضلا عن ذلك تم الكشف جزيئيا عن جينات مقاومة التتراسايكلينات من خلال استخدام البوادئ المخصصة للجينات tetA و tetB و 4640 واظهرت النتائج ظهور الحزم الخاصة بالجينين tetA و 1218 فيما لم تظهر حزم تثبت وجود الجين الثالث. وأخيرا تم التحري عن بعض الجينات المسؤولة عن ضراوة هذه البكتريا وهي كل من: Cnfl و hlyf ssat و iucd و 5/25 ، فأظهرت النتائج احتواء السلالات قيد الدراسة على الجين Alyf من خلال الحجم الجزيئي 1117 زوج قاعدي المستدل عليه من الحزم القياسية، فيما لم تظهر باقي الجينات فيها.
Abstract
A The study included the collection of (112) clinical samples (from wound swabs and burn cases) among patients admitted to the Specialized Center for Burns and Cosmetic Wounds in Mosul for the period from September 2022 until the end of January 2023, for ages ranging from (2 to 55) years for both sexes, and an attempt was made to isolate the types of Citrobacter spp bacteria from them. The results indicated the isolation of (5) strains of Citrobacter spp, three of which belong to the type C. freundii and one for each C. werkmanii and C. farmeri. The isolates were diagnosed based on routine diagnosis and then confirmed using the Vitek-2 device, and using molecular methods by comparing nitrogen base sequences using the 16SrRNA gene at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) using BLAST software. Citrobacter spp. were tested for sensitivity to 12 antibiotics and the results showed that all were 100% resistant to the tetracyclines Doxycycline, Tetracycline and Oxy tetracycline while they were sensitive to Amikacin, Trimethoprim, Nalidixic acid, Norfloxacin, Levofloxacin and Ciprofloxacin. The presence of plasmids in their types was detected and the results showed that all Citrobacter isolates contained plasmids, after which curing of these plasmids was carried out by physical method (high temperature 45 °C) and chemical method (urea at concentrations of 100, 200, 400 μg/cm3). Finally, natural materials were used for the first time, namely onions and garlic in three concentrations (1, 5, 10%) for the purpose of testing their ability as curing agents, the results showed the success of the physical and chemical method in curing, whereas using natural curing for garlic and onion extracts, onions failed with all the concentrations used, while garlic succeeded in curing in concentrations of 5 and 10% only. In addition, tetracycline resistance genes were molecularly detected through the use of precursors assigned to the genes tetA, tetB and tetC, and the results B showed the appearance of bands for the tetA and tetB genes, while no bands proving the presence of the third gene appeared. Finally, some genes responsible for the virulence of this bacterium were investigated, namely: cnf1, sat, hlyf, iucd and sfas, the results showed that the strains under study contain only the hlyf gene through the molecular size of 1117 base pairs inferred from standard bands, while the rest of the genes did not appear in them.
طلب نسخة من الملف
الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.