عزل بعض أنواع البكتريا المعوية من مصادر سريرية ومن أنواع اللحوم ومنتجاتها ودراسة عوامل ضراوتها

الباحث

مهند علي عزاوي عبدالله الجبوري

المشرف

محسن أيوب عيسى احمد العكيدي

الجامعة

جامعة الموصل

الكلية / القسم

كلية العلوم / قسم علوم الحياة

الشهادة

ماجستير

السنة

2022

لغة الرسالة

عربي

الكلمات المفتاحية

البكتريا المعوية ; اللحوم ومنتجاتها ; عوامل الضراوة ; المصادر السريرية

اجريت الدراسة الحالية بهدف التحري عن عوامل shall المختلفة وإنتشارها وتوزيعها في عزلات البكتريا المعوية الممعزولة من مصادر سريرية ومن أنواع اللحوم المختلفة، كذلك التحري الجزيئي عن إنتشار جينات مقاومة المُضادات الحيوية في هذه العزلات. جُمعت لهذا الغرض 66 عينة مختلفة لغرض عزل البكتريا المعوية منها للمدة من 20211911 إلى 20221211 شملت 30 عينة من مصادر سريرية (عينات ادرار Urine وعينات خروج ،(Stool و36 عينة من مصادر لحوم مختلفة (لحوم حمراء وبيضاء طرية ومجمدة) أجريت على العزلات الفحوصات التشخيصية المجهرية والزرعية الكيموحيوية اللازمة فضلاً عن التشخيص بجهاز الفايتك .Vitek-2 أظهرت النتائج تلوث كل أنواع اللحوم المدروسة بالبكتريا المعوية وبدرجات متفاوتة، إذ سّتجلت لحوم الدجاج الطري النسبة الأكبر للتلوث البكتيري المعوي في هذه الدراسة إذ وصل لوغاريتم أعدادها / cae حوالي )8.09( في حين سّجلت عينات اللحوم المجمدة أقل نسبة تلوثء إذ تراوح لوغاريتم أعدادها / غم ما بين (4.71-5.67). واستناداً إلى جميع الفحوصات التشخيصية المذكورة، تم الحصول على 22 عزلة سريرية و57 عزلة من اللحوم تنتمي للعائلة المعوية. توزعت البكتريا المعزولة بين 13 نوعاً مختلفاً تابعاً للعائلة المعوية وهي Enterobacter spp ، Escherichia coli، Citrobacter koseri ، Citrobacter freundii ، Proteus vulgaris، Proteus mirabilis ، Klebsiella pneumoniae: Klebsiella oxytoca Shigella spp، Salmonella typhi ، Salmonella paratyphi A ، Providencia stuartii ، و ،Yersinia enterocolitica ، شكلت بكتريا B coli نسبة العزل الأكثر )32%( من المصدر السريري (الخروج والادرار ) تلتها Enterobacter spp بنسبة )18.2( OSs من Proteus mirabilis و Citrobacter koseri بنسبة )13.6( وبقية الأنواع كانت بنسب أقل. كما شكلت بكتريا coli ,// كذلك نسبة العزل الاكبر من عينات اللحوم )3 بلغت )19%( C. Koseri \gi بنسبة عزل )16%( و Proteus 5 بنسبة )12.3%( وكل من بكتريا (Shigella spps Enterobacter spp) بنسبة )10.5%( وبقية العزلات كانت بنسب أقل منها. أخضعت جميع العزلات ad الدراسة والبالغ عددها (79) Uje لفحص الحساسية تجاه المضادات الحيوية، لغرض معرفة مدى إنتشار صفة المقاومة للمضادات الحيوية بين هذه العزلات وأظهرت النتائج ان معظم العزلات كانت متعددة المُقاومة للمُضادات الحيوية (MDR) Multi-Drug Resistant أختيرت العزلات الأكثر مقاومة للمضادات الحيوية والأكثر تواجداً في مصادر عينات اللحوم المختلفة، قابلها اختيار (Proteus mirabilis ،Enterobacter spp ،E.coli ‘Citrobacter koseri) وهي أربع عزلات سريرية مماثلة لها لمقارنة مدى إنتشار وتواجد عوامل الضراوة المختلفة التي شملت قدرة إنتاج Beta-) ، (Hemolysin) ، (Urease) ، (Licithinase) ، (Lipase) ، (Protease) أنزيمات أظهرت النتائج أن جميع العزلات %100 كانت قادرة (Biofilm) الغشاء الحيوي ¢ Lil; (lactamase عزلات اللحوم والعزلات السريرية Ge (100%) 5 (75%) وإن ،(Beta-lactamase) على إنتاج أنزيم وكان )25%( و )75%( من عزلات اللحوم والعزلات ،Protease على التوالي كانت قادرة على إنتاج أنزيم كل من عزلات اللحوم (75%) ،(50%) 5 Lipase السريرية على التوالي كانت قادرة على إنتاج أنزيم وكانت )50%( من كل عزلات Licithinase والعزلات السريرية على التوالي كانت قادرة على إنتاج أنزيم وان )25%( من عزلات اللحوم والعزلات السريرية Biofilm اللحوم والعزلات السريرية قادرة على تكوين فقد أنتج فقط من العزلات السريرية بنسبة Hemolysin وأخيراً فيما يتعلق بانزيم ، Urease انتجت انزيم .)5040( عن وجود الجينات المُشفرة لإنتاج انزيمات gail إختبار ebay PCR تقنية cask) لمعرفة مدى إنتشار وتوزيع هذه الجينات (bla crx.m ‘bla rem ‘bla suv) وهي Beta-lactamase انتشر في جميع العزلات السريرية bla rem في عزلات اللحوم والعزلات السريرية وبّينت التّتائج ان الجين bla say المختارة )100%( وانتشر في نصف عزلات اللحوم المختارة )50%(، في حين انتشر الجينان بنفس النسبة )75%( 5 )50%( على التوالي في كل من عينات اللحوم والعينات السريرية bla crx-ms المختارة، وقد تشابهت العُزلات المتمائلة من مَصدري العزل في إمتلاكها على الأقل جين واحد من الجينات المدروسة. بالمُقارنة مع العُزلات المرضية من المصادر السريرية أظهرت عُزلات البكتريا المعوية من اللحوم إمتلاك محتوى عالي من عوامل الضراوة وجيناتها فضلاً عن مقاومة المُضادات الحيوية مما يَعكس خطورتها وأهميتها الصحية.

The current study was conducted with the aim of investigating different virulence factors, their prevalence and distribution in enteric bacteria isolated from clinical sources and different types of meat, as well as molecular detection of antibiotic resistance genes spreading in these isolates. For this purpose, 66 different samples were collected to isolating enteric bacteria from them for the period from 9/1/2021 to 1/2/2022, including 30 samples from clinical sources (Urine and Stool samples), and 36 samples from different meat sources (red and white meat, Fresh and frozen) The necessary microscopic and biochemical diagnostic tests were performed on the isolates, as well as the diagnosis with the Vitek2 system. The results showed that all types of studied meat were contaminated with enteric bacteria to varying degrees, as fresh chicken meat recorded the largest percentage of enteric bacterial contamination in this study, where the logarithm of their numbers / g, reached about (8.09), while the frozen meat samples recorded the lowest contamination rate, as the logarithm of their numbers ranged /gm between (4.71-5.67). Based on all the mentioned diagnostic tests, 22 clinical isolates and 57 meat isolates belonging to the enterobacteriaceae were obtained. The isolated bacteria were distributed among 13 different species belonging to enterobacteriaceae, C. freundii, C. koseri, E.coli, Enterobacter spp, K. oxytoca, K. pneumoniae, P. mirabilis, P. vulgaris, P. stuartii, S.paratyphi A , S. typhi, spp. Shigella and Y. enterocolitica. E. coli accounted for the highest isolation percentage (32%) from the clinical source (Stool and urine), followed by Enterobacter spp. (18.2), Proteus mirabilis and Citrobacter koseri (13.6), and the rest of the species had lower percentages. E. coli also formed the largest percentage of isolates from meat samples, which amounted to (19%), followed by C. koseri (16%) and Proteus mirabilis (12.3%) and each of (Enterobacter spp and Shigella spp) (10.5). %) and the rest of the isolates were at lower rates. All of the (79) isolates under study were subjected to an antibiotic sensitivity test, to knowing the extent of the prevalence of antibiotic resistance among these isolates. The results showed that most of the isolates were multi-antibiotic resistant (MDR). A The isolates most resistant to antibiotics and most present in the sources of different meat samples, which are (Citrobacter koseri, E.coli, Enterobacter spp, Proteus mirabilis) were selected compared to the selection of four similar clinical isolates to compare the prevalence and presence of different virulence factors that included the ability to produce enzymes (Protease ), (Lipase), (Licithinase, Urease), (Hemolysin), (Beta-lactamase) and biofilm production. The results showed that all isolates (100%) were able to produce Beta-lactamase , and that (75%) and (100%) of the meat isolates and clinical isolates, respectively, were able to produce Protease , and it was (25%) and (75 percent) %) of meat isolates and clinical isolates, respectively, were able to produce lipase, and (50%), (75%) of meat isolates and clinical isolates, respectively, were able to produce licithinase, and (50%) of meat isolates Clinical isolates are able to form biofilm, and that (25%) of meat isolates and clinical isolates produced Urease, and finally with regard to Hemolysin enzyme, it was produced only from clinical isolates by (50%). PCR technique was used to detect the presence of the genes encoding the production of Beta-lactamase enzymes (bla SHV, bla TEM, bla CTX-M) to determine the prevalence and distribution of these genes in meat and clinical isolates. The results showed that the bla TEM gene was spread in all clinical isolates (100%) and spread in half of the meat isolates (50%), while the genes bla SHV and bla CTX-M were spread with the same percentage (75%) and (50%), respectively, in both meat and clinical samples. The same isolates from the two isolate sources were similar in possessing at least one of the studied genes. In comparison with pathogenic isolates from clinical sources, enterobacterial isolates from meat showed a high content of virulence factors and their genes, as well as antibiotic resistance, which reflects their risk and health importance. B

طلب نسخة من الملف

الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.

الاسم

رقم الهاتف

البريد الإلكتروني

الغرض من الطلب (اختياري)

إرسال الطلب