الكشف الجزيئي عن الزوائف المتألقة وجينات الضراوة من حليب الأبقار والجبن وأسطح الحلمات
Molecular Detection of Pseudomonas fluorescens and its Virulence Genes from Cow's Milk, Cheese and Teat Surfaces
- الباحث
- أحمد حمدي أحمد المتيوتي
- المشرف
- منتهى غازي حسن
- الجامعة
- جامعة الموصل
- الكلية / القسم
- كلية الطب البيطري / الصحة العامة البيطرية
- الشهادة
- ماجستير
- السنة
- 2024
- لغة الرسالة
- عربي
- الكلمات المفتاحية
- الزوائف المتألقة ; جينات الضراوة ; حليب الأبقار ; الجبن
الملخص
يسهم حفظ الحليب ومنتجاته في درجة حرارة التبريد إلى تعرضه للفساد الميكروبي والناجم عن نمو بعض أنواع الزوائف وأبرزها الزوائف المتألقة Pseudomonas fluorescens لكونها من الجراثيم المحبة لدرجة حرارة التبريد psychrotroph وتمتلك قابلية إحداث الفساد بفعل الإنزيمات التي تحلل البروتينات والدهون مثل إنزيم البروتيز وإنزيم اللايبيز خلال BM الخزن. لذا هدفت الدراسة الحالية إلى الكشف عن مدى وجود جراثيم الزوائف المتألقة في حليب الأبقار الخام ومنتجاته في الجبن والأسطح المحيطة له؛ إذ جمعت 200 عينة توزعت بواقع 50 عينة لكل من حليب الأبقار الخام والجبن المحلي و50 مسحة من أسطح حلمات الضرع وخزانات الحليب من مناطق مختلفة في محافظة ccs git أجري العد الكلي للزوائف على عينات الحليب لثلاث فترات زمنية شملت اليوم الأول لجمع العينة وبعد مرور ثلاثة أيام وستة أيام للحليب المحفوظ بدرجة حرارة التبريد. شخصت الزوائف المتألقة اعتمادًا على الخصائص المظهرية فضلا عن التشخيص الجزيئي بتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للكشف عن وجود الجين 657177 1. وأظهرت نتائج الدراسة وجود جراثيم الزوائف المتألقة في عينات الدراسة بنسبة عزل كلية بلغت cus (24.5%) أعلى نسبة لعزل الزوائف المتألقة في حليب الأبقار الخام وبنسبة )38%( ومن عينات الجبن بنسبة (2090)، بينما عزلت الزوائف المتألقة من أسطح حلمات الضرع بنسبة )22%( ومن خزانات الحليب بنسبة )18%( وكان معدل العدد الكلي للزوائف في حليب الأبقار لليوم الأول (4.4) لوغاريتم وحدة تكوين المستعمرة لكل مل وبعد حفظ الحليب بدرجة حرارة الثلاجة لمدة ثلاثة أيام وستة أيام (6.3) و(7.4) لوغاريتم وحدة تكوين المستعمرة لكل مل على التوالي . ES عن ضراوة عزلات الزوائف المتألقة والمعزولة من حليب الأبقار والجبن ومن أسطح حلمات الضرع وخزانات الحليب من حيث قدرتها على إنتاج إنزيم البروتيز وإنزيم اللايبيز اعتمادًا على بعض جينات الضراوة متمثلة JSS: من lipMs aprX واستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل؛ إذ سجلت جينات رون أعلى نسبة وجود في GY je الزوائف المتألقة المعزولة من أسطح حلمات الضرع وبنسبة )%81.8( وسجل أعلى نسبة لوجود جين )%33.3( lipM لعزلات الزوائف المتألقة المعزولة من خزانات الحليب دلالة على ضراوة هذه العزلات. فضلا عن الكشف عن قابلية الزوائف المتألقة المعزولة من عينات الدراسة على تكوين الأغشية الحيوية اعتمادًا على وجود جينات ICs adnd إذ أظهرت النتائج أن عزلات الزوائف المتألقة المعزولة من خزانات الحليب تمتلك الجين adnA وبنسبة (90100)، وأقل نسبة لوجود هذا الجين في عزلات الزوائف المتألقة المعزولة من الجبن وبنسبة )%40( بينما كانت جميع عزلات الزوائف المتألقة سالبة لوجود جين fliC أظهرت نتائج التحليل التتابعي للجين 7667774 تطابق تسلسل الجينات المثبتة في قاعدة بيانات BLAST) Basic Local Alignment Search Tool) والموجودة في الموقع الإلكتروني 5S yall الوطني للمعلومات (NCBI) National Center For Biotechnology as Information سجّل ست عشرة Al je جرثومية من جراتيم الزوائف المتألقة توزعت بواقع اربع عزلات جرثومية لكل من الجبن وأسطح حلمات الضرع وحليب الأبقار وخزانات الحليب Glas, العزلات على الرقم المعرف بالتسجيل Gene Bank Accession Number (PP727372, PP727373, PP727374, PP727375, 6 7 PP727378, PP727379, PP727380, PP727381, PP727382, PP727383, |PP7273784. PP727385, PP727386, PP727387 على التوالي ومن خلال تحليل شجرة النشوء الجيني لهذه العزلات مع العزلات العالمية المسجلة في بنك الجينات لوحظ وجود تقارب العزلات المحلية فيما بينها مع العزلات المسجلة في بنك الجينات والمعزولة من كولومبيا وتايوان والصين والهند ونيجيريا. استنتجت الدراسة تواجد جراثيم الزوائف المتألقة في حليب الأبقار الخام بنسبة اعلى من تواجدها في الجبن وأسطح حلمات الضرع وقدرتها العالية على انتاج إنزيم البروتيز فضلا عن امتلاك عزلات الزوائف المتألقة قابلية على تكوين الغشاء الحيوي الأمر الذي يزيد من ضراوتها وزيادة خطورتها على صحة المستهلكين للحليب ومنتجاته.
Abstract
Preserving milk and its products at cooling temperatures contributes to its exposure to microbial spoilage resulting from the growth of some species of Pseudomonas, the most important of which is Pseudomonas fluorescens because it is a psychotropics bacteria that favorite cooling temperatures and have the ability to cause spoilage by enzymes that hydrolyze proteins and fats such as protease and lipase enzyme during the storage period. The current research aims were to detect the presence of Pseudomonas fluorescens in raw cows milk, cheese and surrounded surfaces in Mosul city, where two hundred samples were collected from different regions in Nineveh governorate, distributed by 50 samples for each of the milk, cheese, teat surfaces and milk tanks. Pseudomonas counts in raw milk were done over three periods including (0,3,6 days) of milk preserved at refrigeration temperatures 4oC. P. fluorescens was detected based on phenotypic characteristics, as well as the molecular detection using the polymerase chain reaction technique to detect the presence of the 16SrRNA gene. The results of the research showed the total recovery of P. fluorescens in all samples were (24.5%) and the higher recovery rate from raw cow milk was (38%), cheese (20%). P. fluorescens was recovered from teat surfaces with a rate of (22%) and from milk tank (18%). The total count of pseudomonas in cow milk was (4.4) Log CFU/ml at the 0 day and after storage for three and six days counts reach to (6.3) (7.4) Log CFU/ml respectively. Also, the virulence factors of P. fluorescens isolates were detected depending on their abilities to produces protease and lipase enzymes represented by both of aprX and lipM genes, aprX gene revealed higher percentage. In P. fluorescens isolates from teat surfaces was at a rate of (81.8%) while higher percentage of lipM gene was (33.3%) in P. fluorescens isolates from milk tank indicating their virulence as well as the b detection of P. fluorescens ability to form biofilms depending on the presence of adnA and fliC genes. Our results revealed the presence of adnA gene in (100%) of pseudomonas isolates from milk tank and low percentage of the presence of adnA gene in P. fluorescens isolates from cheese (40%), whereas all isolates of P. fluorescens were negative to the presence of fliC gene. Sequencing analysis of the 16SrRNA gene showed a 100% match with the sequence of genes in the database (BLAST), which is available on the website according to the National Center for Biotechnology Information (NCBI), sixteen bacterial isolates from the cheeses, teat surfaces, milk and milk tank, four strains to each of them were registered with the accession numbers (PP727372, PP727373, PP727374, PP727375, PP727376, PP727377, PP727378, PP727379, PP727380, PP727381, PP727382, PP727383, PP7273784. PP727385, PP727386, PP727387) respectively. By analyzing the phylogenetic tree of each of these sixteen isolates, it was noted the similarity between these two local isolates with each other and with the rest of the isolates registered in the Genome Bank which was isolated from Colombia, Taiwan, China, India and Indonesia. The study concluded presence of P. fluorescens in cows’ raw milk in high ratio compared to cheese and teat surfaces, these strains possess a higher ability to produce protease enzyme and higher virulence genes to form biofilms which increased their risk on consumers health.
طلب نسخة من الملف
الملفات غير منشورة على الموقع. اترك بياناتك وسيتواصل معك موظفو قسم الشؤون الثقافية والفنون لإرسال النسخة مجاناً.